一、地質生態景觀

馬祖列島為花岡岩錐狀島嶼，受風化及波浪侵蝕作用，多形成崩崖、顯礁及海蝕洞等地形。

馬祖列島具豐富之燕鷗生態及植栽群相。地區不僅為東亞候鳥遷移路線的中繼站，為瀕臨絕種的「神話之鳥—黑嘴端鳳頭燕鷗」繁殖蹤跡，成為生態旅遊的最佳吸引焦點。

此外，馬祖地區得天獨厚的植物群落，皆維持著原始生態。

二、戰地風光

40餘年戰地政務，島上充滿著軍事設施，如坑道、作戰工事、制高點觀測所、據點等，顯要的戰爭地景更凸顯出自然環境條件之特殊。

三、宗教文化

農曆9月初9是「媽祖在馬祖—昇天祭」，「元宵遶境活動」（擺暝）為馬祖地區較具規模之宗教節慶活動。宗教活動結合當地廟宇建築，展現當地的文化特色。

四、聚落建築
馬祖傳統閩東聚落多集中在各澳口，逐坡而建，錯落有致，而在建物採「封火山牆」之設計，為地區特有之閩東建築風格。除了封火山牆的廟宇形式，還有常民住宅的聚落建築，似一顆印式房屋。

海水常沿著節理不斷侵蝕，在海岸常看到海蝕溝的地形景觀（東引）
 

馬祖的傳統民居都是閩東建築的風格，以北竿芹壁村保存較為完整

馬祖的海岸地形相當具有特色，東莒的神秘小海灣是花岡岩節理發育成的海蝕溝、顯礁等地形。