文化、古蹟也是地質公園的重要組成，過去描述馬祖為「一漲一落連江水，一石一瓦閩東情」，如此說明馬祖地景，令人聯想到這是上天灑在閩江口的一串珍珠。同時馬祖也有堅毅的民風，點點滴滴串成了迥異於台灣島的風情。馬祖的建築，也是所謂的閩東建築，民宅建築以花岡岩為材，窗戶位高而小，屋頂如一方方的印章，成為淡定、卻又風格強烈的閩東建築。建築依山羅列，井然有序，彰顯自然地質與文化融合之美，極富人文氣息與特色的地景，是地質公園極具特色的在地元素，也是馬祖觀光遊憩景觀的極致。北竿的芹壁村是馬祖地區保存最完整、最具代表性的閩東聚落。

四落水式紅色屋瓦和厚樸花岡石組成的閩東家屋，背山面海，隨地勢而建的石頭屋，形似印章，故稱為一顆印式建築。屋牆部分，比較講究的採用人字砌法，石材整齊平整，通風透氣，所以又稱會呼吸的房子。" 殺朱拔毛" " 反抗俄寇侵略" " 三民主義統一中國" 等各色" 非常抗戰" 的標語突兀地烙印在屋壁上，這裡有近百棟家屋，但人去樓空，遺留匠心獨具的山牆窗櫺，為早年繁華風情做了最佳的見證。除了上述的芹壁外，東莒的福正、大埔聚落，南竿津沙聚落也是代表性的傳統聚落。

北竿芹壁聚落

以花岡岩堆砌成的方形常民住宅，屋頂上有壓瓦石，稱一顆印式建築

在芹壁村閩東建築的牆壁上，常看到軍事標語

花岡岩堆砌的外牆，有平砌、人字砌等不同工法，有時會呈現多樣的工法